内蒙古自治区总工会于1949年初开始筹建；1955年7月，召开内蒙古自治区工会第一次代表大会；2014年9月，召开内蒙古自治区工会第十次代表大会。全区现有地级市总工会9个、盟工会3个、旗县(市区)工会103个；有8个自治区产业工会及自治区直属机关工会工委，其中，自治区教科文卫体工会、自治区建筑建材交通机冶工会、自治区财贸轻纺农牧林水工会、自治区国防邮电工会、自治区能源化学地质工会5个产业工会驻会，铁路、金融、民航3个产业工会不驻会。自治区总工会设有12个部门、6个事业单位，共有在职干部职工179人。全区共有基层工会6.6万个，工会会员580.5万人，专职工会干部1.8万人，兼职工会干部13.6万人。